本申请公开了一种光学检测机构，包括：光源系统，所述光源系统用于提供激发光；透镜系统，所述透镜系统包括二向色镜、凸透镜、镜筒，所述二向色镜固定在所述镜筒内，所述凸透镜固定在所述镜筒底部；所述二向色镜用于将所述激发光反射至所述载体上的样本中，并使所述样本激发产生的荧光透过；所述凸透镜设置在所述二向色镜与所述载体之间，用于使所述激发光聚焦到载体上的样本中；检测系统，所述检测系统设置在所述荧光透过所述二向色镜后的光路上，用于对所述荧光进行检测。本申请还提供一种检测仪。本申请提供的光学检测机构和检测仪，将各个机构模块化，安装方便，不需要大的空间来操作，可以使得整个仪器进一步小型化，更加便携。