本实用新型公开了一种船用双螺杆泵的机械密封冷却系统。它包括淡水箱，淡水箱连接出水阀，出水阀经淡水管连接循环水泵，循环水泵的出口与双螺杆泵的机械密封冷却腔连接，机械密封冷却腔回水与淡水箱连接。淡水箱内设热交换装置，热交换装置连接海水进水管和海水出水管。本实用新型通过海水来冷却淡水，通过淡水对机械密封冷却腔进行冷却，从而保证机械密封温度不会太高，并防止海水对机械密封内部配件的腐蚀；通过降低进入机械密封内的冷却淡水的压力，减少或防止淡水进入液货系统；采用淡水冷却可有效减少管路脏堵，防止个别机械密封断水；减少杂质对机械密封的磨损，提高使用寿命；并易于及时发现机械密封泄漏，防止对水域环境的污染。