本实用新型公开了一种全自动数字PCR阅读分析系统，包括仪器支架，所述仪器支架上侧放置有开关电源、计算主机、液晶显示屏、主机适配器、控制电路板、USB HUB以及光学模块，所述光学模块底部设有芯片抽屉，计算主机通过主机适配器供电，控制电路板通过USB接口和计算主机相连用以接收来自计算主机的命令进而控制光学模块进行光学成像，本实用新型采用嵌入式一体化设计，内置算法软件，可自动识别芯片并呈现可视化计算结果，无需手动导入结果，操作方便。内置软件系统，可对芯片结果进行分类管理，方便数据调取及对比分析。内置自主研发图像算法，可快速完成芯片阅读和分析（每张芯片从读取到出检测结果可在1.5min内完成）。