本实用新型涉及搅拌设备技术领域，具体为一种生物芯片微流控溶液搅拌机构，包括固定板，所述固定板的表面固定连接有固定件，所述固定件的内部固定连接有第一电机，所述第一电机的输出端固定连接有连接件，所述连接件的一侧固定连接有连接柱，所述连接件通过连接柱和固定头固定连接，所述固定头的一端固定连接有支撑杆。该生物芯片微流控溶液搅拌机构，通过设置第一电机和第二电机在进行使用时，能够通过第一电机和第二电机分别带动第一齿轮和第二齿轮转动，使锥形块能够在第二固定环内运动，搅拌杆做圆周运动，使搅拌翅能够充分搅动生物样品溶液，使目标物与相对应芯片上的生物探针能够相互作用，实现对生物样品溶液的分离。