本实用新型提供了一种水体温室气体采集装置，包括漂浮在水面上的漂浮板和竖直贯穿固定在漂浮板中心位置的透明箱体，透明箱体位于水下的一端开放，位于水上的一端设置有密封盖，透明箱体以漂浮板为界限分为水上箱体和水下箱体两部分，水上箱体内设置有电风扇，密封盖上开设有集气孔，密封盖上安装有温度显示器，温度显示器的感温探头伸入透明箱体内，穿过集气孔设置有连通透明箱体内外的集气管。本实用新型制作简单，成本低廉，易于布置回收，可重复使用，绿色环保，箱体透明，保持了水体自然的呼吸状态，使得气体采集贴合实际，可推广使用。