本实用新型公开了一种新型高效批量培养皿清洗装置，包括底板，所述底板顶面上通过支撑杆固定连接有工作台，所述工作台上固定设有浸泡喷淋区和清洗区，所述浸泡喷淋区顶端后侧固定设有喷淋装置，所述浸泡喷淋区内转动有转动盘，所述清洗区后侧固定第一驱动装置和第二驱动装置，所述第二驱动装置固定安装在第一驱动装置顶部。本实用新型通过挡板和隔离装置的设置，可以有效的阻挡外界的灰尘和工作人员的头发进入，减少清洗时间和清洗难度，保证了后续培养皿的正常使用，并且设置了第一驱动机构和第二驱动机构，利用脚踩弹性踏板，就可以完成对挡板和隔离装置操作，使得整个装置使用起来非常的方便，有效的提高了工作效率。