本实用新型提供了一种浮游生物收集分离装置，该装置包括一收集罐以及与收集罐相连的培养罐，收集罐底部设有一抽水泵，抽水泵的上方设有一光源发生器，光源发生器用于将浮游生物驱赶至所述培养罐中，光源发生器为遥控设置，抽水泵的外部设有一过滤网，过滤网用于将所水中的杂质过滤，抽水泵上设有一抽水管，抽水管连接于水源中，在收集罐下部还设有一排水口，在收集罐上部设有一虹吸管，虹吸管的一端连接设于培养罐的上部，在虹吸管上还设有一阻流器，在培养罐的上部还设有一上水口，在培养罐的下部设有一下水口，在收集罐与培养罐之间还设有一连接杆。本实用新型提出的浮游生物收集分离装置解决了人工对样品进行采集挑选，导致纯化处理效率低下的技术问题。