本实用新型公开了一种微生物检验用萃取器，包括底座，所述底座的一侧外壁设置有清洁接头，且底座的一侧外壁设置有排水管，所述底座顶部外壁的一侧设置有支撑柱，且支撑柱外壁的两端均套接有安装环，两个所述安装环的一侧外壁设置有安装杆，且两个安装杆的外壁均设置有固定套，两个所述固定套的上分别套接有冷凝管和提取管，所述冷凝管通过管道连接在提取管的上，所述底座底部内壁的一侧设置有储液箱，所述底座底部内壁通过螺栓固定有水泵。本实用新型通过在底座上设置储液箱和水泵，通过水泵将消毒液体直接抽取进冷凝管中进行冲洗，便于冷凝管的直接冲洗，解决了现有的萃取器在清洗麻烦的问题。