本实用新型公开了一种微生物恒温培养一体化设备，包括箱体和顶盖，所述箱体和顶盖通过卡扣固定连接；所述箱体下部安装高温灭菌及恒温系统，所述高温灭菌及恒温系统上方设有微孔结构衬板，所述微孔结构衬板上放置多组培养罐；所述箱体两侧顶部设有通风装置，所述通风装置前端连接有空气过滤器；所述顶盖上安装可拆卸的接种管和微型搅拌机，所述微型搅拌机的搅拌转子伸入所述培养罐内部；所述箱体一侧设有进水阀，另一侧设有放水阀。本实用新型一体化设备具有消毒、扩培一体化的优点，可以减少实验室大量扩培菌液的操作，减少仪器设备的占用。