一种甲醇燃料舷外机双涡轮增压闭环控制高效净化系统，有上下固定连接且连通的舷外机水上装置壳体和舷外机水下装置壳体，舷外机水上装置壳体内设置有N缸内燃机，连接在N缸内燃机的气缸盖排气口上的排气主管，连接在N缸内燃机的进气端的进气岐管，排气主管的出气端通过废气涡轮增压装置连接排气通道，将N缸内燃机所排出的废气和噪声排入到水下，排气主管和排气通道内均设置有净化催化填充体，进气岐管上分别设置有与废气涡轮增压装置、电动涡轮增压装置和甲醇燃料闪蒸气净化再利用装置的各出口相连的四个进气口，N缸内燃机的点火机构连接点火正时角度自动调整装置。本实用新型避免了由于直接将废气和污物排入水体，造成对生态环境的破坏。