本申请涉及一种应用于磁共振系统的馈通滤波器和磁共振系统，包括屏蔽壳、电路板和滤波元件，所述滤波元件设置在所述电路板上，并通过电路板走线互连；所述屏蔽壳罩设于所述滤波元件外侧。本申请通过将馈通滤波器设置在电路板上，一方面减小了馈通滤波器的体积，另一方面，匀场放大器和馈通滤波器之间不需要线缆连接，以上两个方面均能大幅度降低成本，而且还可以提高馈通滤波器和磁共振系统的稳定性。