本实用新型提供一种蒸馏净水设备的水垢控制单元，包括依次串连的结垢加热箱、泵体以及后加热装置，该结垢加热箱用于将原水加热至60℃以上，该泵体用于将结垢加热箱中的水输送至后加热装置中，该结垢加热箱包括圆筒形的筒体和端盖，所述筒体下端经排污阀连接有排污管，该筒体设有出水管和进水管，该筒体外侧套设有加热盘管，所述端盖上设有除垢装置，该除垢装置包括穿过所述端盖的转轴和用于驱动该转轴旋转的电机，所述转轴下端连接有刮板，本实用新型增加了形成并容纳水垢的中间加水箱，减小了水垢对换热器的影响，延长了换热器的使用时间。