本实用新型公开了一种全自动内镜清洗消毒机的自动开关门系统，包括机箱，所述机箱的右端下部边缘处固定连接有第一固定板，所述第一固定板的上端右部设置有伸缩挤压装置，所述伸缩挤压装置贯穿机箱的右端下部前侧，所述机箱的左右箱壁上部均固定连接有一个第二固定板，所述第二固定板的相对面均开设有一个第一滑槽，所述第一滑槽的槽壁设置有放置装置，所述机箱的左侧箱壁下部开设有第三滑槽，所述第三滑槽的槽壁连接有开关门装置。本实用新型所述的一种全自动内镜清洗消毒机的自动开关门系统，通过三角挤压板往左运动挤压设备门往上运动直到机箱的上壁为止，同时第二限位杆对设备门起到限位稳定作用，使得设备门的方便开关，提高了便利性。