本实用新型公开了一种天然糖蛋白加工纯化一体化设备，包括箱体和转子电机，所述箱体的内部底端固定有转子箱，且转子箱的内部底端固定有转子电机，所述转子电机的右侧固定有第一旋转轴，且第一旋转轴的右侧固定有第一锥形齿轮，所述第一锥形齿轮的顶端表面与第二锥形齿轮的底端相啮合，且第二锥形齿轮的顶端固定连接有第二旋转轴，所述第二旋转轴的顶端通过轴承座连接有连接杆。本实用新型设置有盛放槽和密度梯度区分管，通过固定块使密度梯度区分管转动，从低速到高速不断循环，使的糖蛋白纯化颗粒可以一次纯化成型，通过密度梯度区分管内部设置的密度梯度物质，避免颗粒之间发生碰撞失去活性。