本实用新型公开了涉及生态系统技术领域的河道生态系统，解决了自净作用效果较差的问题。其技术要点是：包括净水基体，净水基体设有浅水种植槽、深水种植槽和复合菌剂养殖槽，浅水种植槽、深水种植槽和复合菌剂养殖槽沿河流流向依次排布，浅水种植槽的高度高于深水种植槽的高度，深水种植槽的高度高于复合菌剂养殖槽的高度，浅水种植槽和深水种植槽内均种植有水生植物，复合菌剂养殖槽内设有培养载体。通过浅水种植槽、深水种植槽和复合菌剂养殖槽的相对位置结构，提高了河道生态系统的自净能力，使河道生态系统能应对更严重的污染条件，尤其适合应用于城镇中宽度小于10米的河道。