本实用新型提供了一种利用组合生物技术净化黑臭水体的装置，装置包括曝气箱、反应箱、植物吸收箱、纳米曝气管、悬浮筐、进水管、出水管、蠕动泵、充气泵。曝气箱、反应箱、植物吸收箱依次设置有海拔高程差。黑臭水体经曝气箱曝气后，向反应箱中投加微生物菌剂、促生剂、填料，使水体中降解污染物的微生物多样性及生物量迅速提高，从而污染物被高效去除，使水体水质提升，最后向植物吸收箱中栽入植物，植物进一步吸收水体中污染物，使水体水质进一步提升。其中所述的微生物菌剂为土著菌剂，其主要成分为光合菌、硝化菌、放线菌及酵母菌，促生剂为生物促生剂BE，填料为弹性立体填料，植物为水花生。本实用新型实施简单易行、成本低、无二次污染。