本实用新型公开了一种底泥采样器，包括采样筒，所述采样筒竖向设置，其筒口位于顶部，其筒下部开设有通孔；还包括横向支撑杆和竖向掘进支撑机构，多个竖向掘进支撑机构分别通过横向支撑杆呈圆周阵列设置于采样筒外周，且采样筒通过竖向掘进支撑机构掘进河道河床的带动使得通孔完全陷入河道底泥中；采样筒内部设置有活塞，活塞连接有穿过筒口延伸至采样筒外部的推拉杆，通过推拉杆拉动所述活塞朝向筒口移动可将河道底泥通过通孔吸入采样筒内。本实用新型提供的一种底泥采样器，稳定性好，取样准确、可靠，且能过滤掉底泥样品中的部分固体杂质。