本实用新型公开了一种高压等离子水处理系统，包括：第一水处理设备，所述第一水处理设备用于释放出紫外线和臭氧；第二水处理设备，所述第二水处理设备包括高压包和管道设备，所述高压包释放出高压电并通过管道设备将高压电传递至污水中，使得污水中的正负离子分离并得到有序排列；所述紫外线和臭氧在高压电的作用下，使蛋白质变异。本实用新型通过两套水处理设备的结合，一方面，实现了紫外线和臭氧的杀菌以及高压包的正负离子分离；另一方面，通过蛋白质中的核酸变异，阻碍其复制、转录封锁及蛋白质的合成；同时，产生自由基可引起光电离，导致细胞的死亡，阻止了嗜铁菌等的生产，避免了三价铁沉淀物等的堆积，净化了水环境。