本实用新型涉及一种天窗控制系统，包括：电源电路、磁力锁控制电路、磁力锁、电机控制电路和电机；其中：所述电源电路用于为天窗控制系统供电，并连接所述磁力锁控制电路和电机控制电路；所述磁力锁用于在通电时吸合天窗，所述磁力锁控制电路与所述磁力锁连接，用于控制所述磁力锁的通电断开，进而控制所述天窗从闭到开；所述电机用于带动所述天窗从开到闭，所述电机控制电路与所述电机连接，用于控制所述电机的正反接，进而控制所述天窗从开到闭。上述天窗控制系统通过电机控制电路和电机，控制天窗自动复位，避免了天窗掉落后需要人为挨个翻转天窗进行复位闭合，效率低的问题，提高了效率。