本实用新型公开了一种生物蛋白加工用固液分离机构，包括箱体；所述箱体的顶端固定安装有转动电机，所述转动电机的电机轴贯穿于箱体的顶侧且轴头通过联轴器与转轴连接，所述转轴的外圈固定安装有若干搅拌杆，所述箱体内部的中端水平安装有隔板，所述隔板的前侧横截面呈等腰梯形状，所述隔板的顶侧呈开口状，所述隔板底端的左右两侧均固定安装有出料管a，两个所述出料管a上均设置有电磁阀，所述箱体前侧的下侧呈开口状。本实用新型通过设置的转动电机和两个推杆电机，便于通过启动转动电机对箱体内的蛋白离心搅拌，并通过滤膜过滤后，可通过启动两个推杆电机，将滤膜上的蛋白刮下来，从而便于使用者的回收，较为实用，适合广泛推广和使用。