一种多功能CPCIe工控机主板，包括印制板Ⅰ、印制板Ⅱ，所述印制板Ⅰ和印制板Ⅱ均固定在前面板上，印制板Ⅰ和印制板Ⅱ之间通过固定螺柱连接；印制板Ⅰ上固定有处理器模块，印制板Ⅰ通过母板连接器连接母板，印制板Ⅰ上连接有散热器，印制板Ⅰ和印制板Ⅱ之间通过板对板线缆通信连接；印制板Ⅱ上固定有硬盘，硬盘通过板对板线缆与处理器模块通信。本实用新型的工控机主板预留部分总线接口，若主板功能发生变化时，可通过预留接口进行功能扩展，无需进行重新设计，提高了主板插件的可扩展性。主板大部分关键电路采用模块或接口板形式设计，若发生故障损坏时，可直接替换对应部分即可，无需更换整个插件，节省了成本。