本实用新型提供一种温度采样控制系统，包括：供电模块、多通道温度模拟采样模块、模拟选择开关、隔离模块、控制器和外设电路；所述供电模块，用于为所述模拟选择开关、隔离模块、控制器供电；所述多通道温度模拟采样模用于采集多路温度模拟量；模拟选择开关用于将其中一个模拟采样通道的温度模拟信号输入至所述隔离模块；隔离模块将所述温度模拟信号传输至所述控制器；控制器用于根据接收的温度模拟信号发送控制指令至所述外设电路，该系统采用多通道模拟隔离型采样系统，从而解决现有方法容易受到电网的电磁干扰或能量脉冲干扰，进而影响温度采样的准确性、安全性和可靠性的问题。