本申请涉及全自动化学发光领域，具体是涉及一种全自动POCT多重检测液相芯片系统，其包括有安装架，所述安装架上分别安装有加样臂、磁分离组件、光路系统和主控板，光路系统及主控板位于安装架的顶部，光路系统包括第一激光器和与之对应的第一反射镜架，第二激光器和与之对应的第二反射镜架，第二反射镜架旁设置有流动室，流动室和第二反射镜架之间设置有双胶合透镜，流动室周围设置有第一侧向荧光收集组件、第二侧向荧光收集组件和向前散射光收集组件。本申请的光路系统采用模块化设计，可以根据客户需求灵活配置。荧光收集系统可采用单片大数值孔径非球面聚焦透镜，结构简单可靠，稳定性高。