本实用新型公开了离心机中的主轴密封结构，在前轴承座端盖与主轴之间设置有密封固定套装在主轴上的双螺旋密封套，在双螺旋密封套的外壁上沿轴向设有两段螺纹密封槽，两段螺纹密封槽的螺纹旋向相反，两段螺纹密封槽通过进气机构能与离心机外的保护气气源相通，工作时保护气气源向两段螺纹密封槽输送保护气，使两段螺纹密封槽内分别形成密封前轴承座端盖与主轴之间间隙的气封，当双螺旋密封套随主轴转动时，双螺旋密封套上靠近工作腔的螺纹密封槽会将进入该螺纹密封槽的保护气向工作腔侧排气，同时双螺旋密封套上靠近传动腔的螺纹密封槽会将进入该螺纹密封槽的保护气向传动腔侧排气，密封隔离工作腔与传动腔。本实用新型有密封效果好的优点。