本实用新型公开了一种轨行区上方一体化开发的城际铁路地下车站，包括铁路功能区和一体化开发区两个区域，铁路功能区由下至上设置的地下三层铁路站台层、地下二层铁路出站厅、地下二层小汽车停车场、地下二层出租车上客区、地下一层铁路候车厅，地下一层铁路商业区以及地上轻型结构共同组成；通过铁路出站厅两侧城市通廊以及下沉广场，实现与地铁换乘厅、地铁出站厅便捷进行连通；候车厅的层顶为地上轻型结构，通过地上轻型结构及玻璃幕墙实现将自然光引入候车厅；在铁路出站厅、候车厅设采光中厅将自然光引入站台层。本实用新型在轨行区正上方的一体化开发，可以利用地下车站既有空间上方土地，减少物业开发新占地面积，提高开发区域的土地利用率。