本实用新型公开了一种用于生物制药的分离纯化装置，包括分离箱、出药机构、冷凝机构和吸气机构，其特征在于：所述分离箱的一侧安装有冷凝机构，所述分离箱的一侧也安装有吸气机构，所述分离箱的一侧还安装有储药罐，储药罐的一侧安装有出药管，所述分离箱的底部安装有连接口，且连接口上安装有第二电磁阀，所述连接口的底部连接有出药机构，所述出药机构的底部安装有底座，所述分离箱的另一侧安装有第一出料口，本实用新型通过设置有冷凝机构使气态的药液变成液态的目的，使用时，通过启动第二风机，第二风机就会使冷凝箱中的空气流动，空气经过冷凝管和冷凝剂，把第二连接管中的热量给带出，这样第二连接管就会进行冷凝形成液体方便收集药液。