本实用新型公开了一种医疗垃圾处理设备的上料系统，包括夹持机构、连杆、滑道、翻盖系统、翻转小车、驱动小车和驱动机构，所述滑道由直线段滑道和曲线段滑道组成，曲线段滑道靠近直线段末端，所述曲线段滑道滑槽较浅，直线段滑槽较深；所述驱动小车上端通过铰链与翻转小车下端连接，驱动机构驱动两小车在滑道上运行，小车每侧有两车轮，驱动小车在直线段滑道中运行，翻转小车后轮在直线段运行，前轮在曲线段滑道中运行，所述夹持机构固定翻转小车上，所述翻盖系统包括翻盖和翻盖转轴，翻盖一端通过翻盖转轴连接垃圾处理设备，另一端与连杆转动连接，连杆另一端与驱动小车转动连接。保证上料和容器翻盖同时完成，减少有害微生物扩散到空气的风险。