本实用新型公开了一种无菌原料药用进出料隔离器，包括矩形箱体，所述矩形箱体包括上下连通的上箱体和下箱体；所述上箱体的底部开设有延伸至所述下箱体底部的对接门，所述对接门与无菌洁净层流车对接；所述上箱体的左右侧面上安装有移门，所述上箱体的背面安装有与冻干机对接的镂空板；所述下箱体内安装有升降装置，原料药料桶放置在所述升降装置上。本实用新型通过手孔和无菌操作手套的设计，可有效避免环境中细菌的混入，提高药品的质量；通过升降装置的设计，可以根据冻干机的板层高度调整升降台面的高度，使得冻干盘可以稳定的转移至隔离器内；本实用新型为原料药无菌出料提高有效保护，工作效率高，实用性强。