本实用新型涉及一种无菌隔离器，属于空气净化技术领域。本实用新型解决了现有无菌隔离器存在的物料传送不便，隔离设计不合理的问题。本实用新型包括隔离主仓和一侧的VHP灭菌缓冲仓，隔离主仓和VHP灭菌缓冲仓顶部均设有层流罩，层流罩的顶部通过管路依次连通过滤器和隔离空调系统，隔离空调系统进气端连通有隔离器进气管，隔离主仓和VHP灭菌缓冲仓的底部均设有隔离回风管，所述隔离回风管连通到隔离器进气管上，所述VHP灭菌缓冲仓的顶部通过管路连通有缓冲VHP发生器；所述过滤器底部管路通过比例阀后分别连通在VHP灭菌缓冲仓和隔离主仓上的层流罩，控制进入到内侧的空气压力，并使隔离主仓的压力大于VHP灭菌缓冲仓内的压力。