本实用新型公开了一种隔离器无菌连接装置，包括连通两个隔离器的无菌连接组件，所述无菌连接组件包括两个宝塔接头以及连通两个宝塔接头的输送管，宝塔接头中部设有用于将宝塔接头固定在隔离器上的限位块，宝塔接头位于限位块一侧的端口为输送管接口，位于限位块另一侧的端口为隔离器接口；宝塔接头的两端设有倾向其端口的阶梯状环形坡面，两个宝塔接头的输送管接口通过输送管连接，两个宝塔接头的隔离器接口分别与两个隔离器中连接待传输物质的连接管连接。该装置结构简单，便于拆卸和更换，提高了隔离器间物质无菌传输的工作效率。