本实用新型公开了一种用于对深度污染河道处理及原位修复的生态沉床及其方法，属于环保设备领域。该生态沉床中包括框架主体，框架主体划分为位于两侧的植物种植区域和位于中间的填充区域；植物种植区域用于种植水生植物，而填充区域由下至上依次分层填充有沸石、固化微生物填料以及立体弹性填料。本实用新型的特点是结合填料和沸石表面的物理吸附和微生物降解作用，以及芦苇等植物的净化功能，多重方式净化水体，并设计刀口用于切割芦苇，解决浮床因下雨水流速度大，阳光暴晒，易受损坏，耐受时间短等不利条件以及因芦苇扎根导致回收困难的问题。本实用新型生态沉床的材质无毒无害，不易损坏，经久耐用，结束后便于回收再次使用，不会产生二次污染。