本实用新型提供了一种长轴深井泵的泵轴密封结构，包括密封压板、机械密封件、密封件定位套环，泵轴穿过密封压板、机械密封件和密封件定位套环，所述机械密封件包括环套在泵轴外部自上至下依次分布的静密封环、动密封环、弹簧和弹簧托板；所述密封件定位套环整体呈圆环状，密封件定位套环的一侧环体上设有一完全断开的收缩缝、另一侧环体内侧设有切开一半环体的变形缝，所述收缩缝两侧的环体利用收缩螺栓连接。本实用新型的机械密封弹簧底座采用环抱式固定，不易松动，不会出现倾斜现象，不存在顶丝对泵轴的损坏，延长了械密封件的使用寿命，降低了长轴深井泵的使用维修成本，具有结构简单，安装方便的优点。