一种功能微生物种液培殖增效反应器，包括培殖储存箱、生物填料、悬浮机构、进水泵、布气盘、配氧装置、控制器、微生物种液射流器和微生物包埋模块；培殖储存箱上设有缓释仓，微生物包埋模块设置在缓释仓中；微生物种液射流器包括高压水泵、吸水管、输水管和射流水管，射流水管的外端自培殖储存箱的侧壁伸出到外面。通过增设微生物种液射流器和微生物包埋模块，释放预先选定的功能微生物，形成次级功能微生物种液并储存在培殖储存箱中，而微生物射流器则将次级微生物种液抽取并射出到周边水域的淤泥表层，射流输出的次级功能微生物种液快速渗入并寄驻于水底淤泥，对污水原位就地进行净化处理，而且使淤泥中的有机物得以处理，使淤泥还原为沙土。