一种微耕机专用变速箱，包括箱体、操作机构、主轴、副轴，箱体包括箱本体及罩设于箱本体顶部的盖体，操作机构包括第一拨杆、第二拨杆、第一拨叉、第二拨叉、第三拨叉及拨叉轴，第一拨杆与第一拨叉连接，第二拨杆可根据需要连接第二拨叉、第三拨叉；主轴包括第一主轴和第二主轴，第一主轴上套装有输入齿轮，输入齿轮上设有第一插槽，第一拨叉的第一拨叉片伸入该第一插槽，第二主轴固套有第一主齿轮，套装有第二主齿轮和第三主齿轮，第二拨叉的第二拨叉片伸入第二主齿轮和第三主齿轮之间，副轴包括第一副轴和第二副轴，第一副轴上活套有第一副齿轮和第二副齿轮，第一副轴上固套有快挡从动齿轮和慢挡从动齿轮，第二副轴上活套有倒挡齿轮。