本实用新型公开了一种微耕机变速箱总成，包括动力输入的主轴和副轴，所述主轴和副轴均呈水平设置，在主轴上空套有换挡三联齿，在副轴上套设有与其固定连接的固定三联齿，所述换挡三联齿能够在一换挡拨叉的拨动下左右移动，并与固定三联齿上相应挡位齿轮啮合，实现换挡；在换挡三联齿下端还设有与其通过齿轮组件相连的耕刀动力输出机构，所述耕刀动力输出机构包括一主动链轮和输出轴，所述主动链轮能够在齿轮组件的带动下转动；所述输出轴位于主动链轮斜下方，在输出轴上设有与其固定连接的从动链轮，在主动链轮和从动链轮上套设有一个与其相配合的链条；所述主轴中轴线与主动链轮和从动链轮中心连线之间的夹角在65‑75°之间。