本实用新型公开了一种用于河道湖泊快速及深度除藻系统，它包括依次连通的除磷反应区、固液分离区、浓缩区和干化区；所述除磷反应区外接取水器，所述固液分离区外接溶气系统。通过该系统能快速实现对河道湖泊中蓝藻现象的消除和从河道湖泊根本上消除蓝藻爆发源头，通过该系统的处理蓝藻能得到很好控制，同时经该系统处理产生固态废弃物经设备减量化处理量非常少，便于后期处理和减少对环境二次污染。