本实用新型提供的一种可存纯水的滤芯结构及应用其的泡膜净水系统，该可存纯水的滤芯结构，包括滤瓶，所述滤瓶上设置有第一进水口、第一出水口及存水进出口；所述滤瓶内设置有软质水罐体，所述软质水罐体内设置有滤芯组件；所述滤芯组件的进水端与所述第一进水口连通形成有第一进水流道，所述滤芯组件的出水端与所述第一出水口连通形成有第一出水流道，所述水罐体外侧与所述滤瓶内侧之间形成有与所述存水进出口连通的存水流道。该滤芯结构的设置应用，可降低净水系统待机后重启的首杯水TDS值。