本实用新型公开了一种微生物细胞破壁装置，涉及细胞破壁领域，针对现有的微生物破壁装置，其结构简单，对细胞破壁较困难，使用起来不方便，细胞破壁率低，造成细胞破壁不充分，影响提成物质的使用时，不利于细胞破壁的使用问题，现提出如下方案，其包括框架、存储室和破壁室，所述框架下端左右两侧均设置有支撑座，所述框架上端左侧设置有进料口，进料口下端与存储室连通，所述框架内中部设置有支撑板；本实用新型中，水泵工作，通过进水管将未能完全破碎的微生物细胞吸入，经过水泵上端的回流管输送到存储室内，进行再次破壁，使微生物细胞被充分破壁，提高了破壁率，有利于微生物细胞破壁使用。