本实用新型公开了一种微生物细胞破壁装置，涉及细胞破壁领域，包括预处理仓，所述预处理仓的顶端设置有进料口，且进料口的一侧安装有第一电机，所述第一电机的输出端连接有破壁刀，且第一电机的底端设置有气缸，所述预处理仓的一侧设置有高压泵，且高压泵的输入端设置有输入管，所述高压泵的输出端连接有输出管，且输出管的一端设置有破壁仓，所述破壁仓的内部设置有固定盘。本实用新型实现了在预处理仓的内部通过启动第一电机使得第一电机带动破壁刀对细胞壁进行预破碎，达到预处理的目的，然后通过高压泵将混合物抽取喷射在固定盘的内部，通过多组分料腔将其喷射在撞击盘上，撞击盘高速旋转，从而进行二次破壁，使得细胞破壁效果好。