本实用新型提供一种培养皿集中消毒翻转分拣装置，包括用于输送消毒池中浸泡的培养皿的提升输送机以及位于提升输送机的出料口下方的振动分料槽，振动分料槽的底侧安装有用于将槽内盛装的培养皿振荡均匀的电磁振荡器；振动分料槽的出料处可拆卸连接有若干个滑槽，每个滑槽内安装有检测锁定机构，用于检测滑槽内的培养皿是否开口方向一致，并固定夹紧开口方向不一致的培养皿；本实用新型利用翻转顶推机构将检测出的开口方向不一致的培养进行顶推翻转过来，这样就有效的降低了已消毒过的培养皿因出现开口方向不一致，而出现二次污染的发生几率。