本实用新型涉及水泵主轴技术领域，且公开了一种泵轴密封结构，包括基座，所述基座的顶部固定安装有电机，所述基座的顶部固定安装有位于电机左侧的水泵，所述水泵的内部活动安装有固定座，所述电机的输出轴处固定安装有贯穿水泵并延伸至固定座内部的泵轴本体，所述固定座内的顶部与底部均活动安装有活动块，所述固定座的顶部与底部均开设有螺纹孔。该泵轴密封结构，通过螺杆式固定螺栓转动的同时，便于带动其底部的活动块旋转下降，从而使活动块在活动槽的内部推动固定块运动，从而使固定块运动的同时贴合泵轴本体，减少配合间隙，避免了水泵主轴产生晃动后加剧其本身和水泵内孔的磨损坏死的问题。