本实用新型提供了一种流动式纳米磁珠合成装置，包括混合长管、第一加料管、第二加料管、第三加料管以及加热组件，混合长管包括管体和多块混匀板，每一混匀板均一端与管体连接，另一端逐渐向下延伸，多块混匀板交错设于管体内。上述流动式纳米磁珠合成装置，中间混合长管体积小，并设置混匀板，便于反应液混匀，同时，管体是外部设有加热组件，提高了反应速率，反应液可在管体中可迅速达到平衡，其中第一加料管用于放置硫酸亚铁溶液，第二加料管用于放置氢氧化钠溶液，第三加料管用于放置过氧化氢溶液，反应时，第一加料管和第二加料管内的溶液先生成氢氧化亚铁，然后第三加料管内的溶液氧化为四氧化三铁，大量合成时连续加料即可，操作方便。