本公开涉及一种在实现减振的同时还能兼顾自身结构可靠性的多旋翼无人机的飞控系统和多旋翼无人机，飞控系统包括：控制器单元，控制器单元包括控制器主体和壳罩，控制器主体形成有基座且适于固定于多旋翼无人机的机身或机架；传感器单元，传感器单元用于采集激励载荷频率ω信号，传感器单元与控制器单元通信连接；减振单元，减振单元由阻振件和配重块组成，传感器单元固定于配重块，配重块、阻振件和控制器主体沿纵向依次层叠并且其中相邻的两者彼此连接；以及，限位件，限位件具有弹性；限位件、配重块和阻振件位于基座和壳罩限定的封闭空间中，并沿纵向方向依次层叠且相邻两者彼此连接，限位件间隙配合在壳罩中，阻振件连接在基座上。