本实用新型公开了一种浮游菌采样器，包括外壳、采样头本体、采样盖和滤板，外壳内壁上固定连接有安装架，安装架中固定安装有驱动电机，固定环上固定连接有连接杆，连接杆在一端贯穿套杆并延伸至套杆内部与限位板固定连接，限位板底端固定连接有复位弹簧，复位弹簧偏离限位板的一端固定连接在套杆内部底端，套杆底端活动卡接在挡板上，采样盖顶端固定连接有把手，采样盖底端边缘上固定连接有密封圈，该浮游菌采样器，通过设置滤板可以使空气中的微生物均匀的撞击到培养皿上，利用采样头本体与采集口处通过螺纹连接的方式，有利于拆卸采样头本体，达到便于更换的效果，解决了采样头不便于更换，且微生物容易在培养皿上重叠的问题。