本发明公开了一种复制应用的方法，包括：虚拟机部署待复制的应用服务，每个应用服务包括若干个应用；虚拟机创建若干个应用盒子，每个应用盒子用于存储一个待复制的应用服务；每个应用盒子包括若干个应用空间，每个应用空间对应应用服务的一个应用；虚拟机将待复制的每个应用服务中的每个应用及安装所述应用所依赖的应用打包并存放在对应的应用空间中；虚拟机将每个应用盒子分别打包，拷贝至目标机器；目标机器将应用服务端口和操作系统端口做映射，完成应用服务部署。本发明还公开了一种复制应用的系统，将应用打包成独立文件存储，当单个应用依赖出错时，使用应用程序管理器的应用管理模块更新变化应用空间文件，提高复制和部署速度。