本发明涉及服务器技术领域，提供一种基于FPGA的状态机状态监控处理方法及系统，方法包括：FPGA的状态机上电后，以轮询的方式实时读取状态机的每一个状态编码，将读取到的每一个状态编码与预先配置生成的与当前读取的状态相匹配的状态参考编码相比较，判断两者是否一致；当判定读取到的当前的状态编码与预先配置生成的状态参考编码相一致时，则判定当前状态处于正常状态；当判定读取到的当前的状态编码与预先配置生成的状态参考编码不一致时，则应用预先配置生成的状态参考编码替换当前读取状态的状态编码，从而能够检测出状态机的非法状态并将状态机恢复到正常状态，保障状态机运行的连贯性，以及状态机的容错性和可靠性。