本发明属于物联网微服务技术领域，公开了一种物联网故障检测方法、检测系统、存储介质，分析物联网应用中的多种故障类型，设计相应的故障注入方法，并收集产生故障的应用中的环境配置和内部状态信息。对获取的环境配置和内部状态信息利用树形结构的微服务状态表示法进行准确分析，同时利用调用树之间的相似度计算方法检测应用中的多种故障类型。本发明提出了基于故障注入方法的故障诊断框架及树形结构的微服务状态表示法，实现了应用内部状态准确描述，并提出了一种调用树之间的相似度计算方法，检测应用的故障类型，通过实验验证了本发明方法的可行性。