本发明提出一种用于菊芋联合收获机的根芋分离装置，包括安装架、机架、缓冲胶指辊、块茎导向板、间隙调节机构、齿轮箱、液压马达、清杂辊子、液压油缸和间隙控制系统箱，根据当地种植菊芋块茎的数量、品种等，调整机架的倾斜角度，由块茎、根茎和杂余等组成的混合物在重力和清杂辊子的转动作用下，沿指定方向运动，在这个过程中，清杂辊子相对转动将混合物中的根茎和杂余分离出来，分离出的根茎和杂余进入根茎汇集装置，剩余的块茎流沿着指定方向撞击缓冲胶指辊，降低运动速度后按缓冲胶指辊的转动方向将块茎以较低的速度输送至其它料斗中，降低碰撞损伤。本发明实现了将块茎从根茎和断碎秸秆中分离出来，且损伤率低、含杂率低。