本发明公开了一种智慧山体初雨调蓄除污系统及其原位自驱动利用方法，先利用人工洼地对雨水径流缓冲，再根据雨水径流的速度，利用尖斗排砂池、生物滤池对雨水进行泥水分离，并排入陶粒池，最后流入储水段；将储水段中的水排至城市景观用水和对生物滤池中的草本植被进行灌溉，该系统还实时检测尖斗排砂池内和生物滤池中沉淀池内的压力，若降雨后尖斗排砂池内的压力与降雨前的压力之差大于阈值，通过自动阀门和第一反冲洗排泥管将尖斗排砂池内的污泥排出；若降雨后尖斗沉淀池内的压力与降雨前的压力之差大于阈值，则抽取储水段内的水对沉淀池进行冲洗。本发明解决了初期雨水污染严重、雨水资源季节性利用不均衡等问题，同时还提高了雨水的水质。