本发明公开了一种具有生物材料处理结构的分离纯化装置，包括设备底座、摆动力臂、扇形盘、齿牙条和限位套管，所述设备底座的正上方设置有纯化罐体，且纯化罐体的外侧嵌套连接有检测仪表，所述纯化罐体的正上方卡合连接有密封盖板，且纯化罐体的一侧设置有传动箱体，所述传动箱体的正上方设置有驱动电机，且传动箱体的一侧轴连接有旋转圆盘，所述旋转圆盘的外侧焊接固定有旋转杆，所述齿牙条的外侧焊接固定有筛选箱体，且齿牙条的外侧嵌套连接有限位套管。该具有生物材料处理结构的分离纯化装置，设置有摆动力臂与齿牙条，通过摆动力臂带动筛选箱体进行左右移动，方便根据固体材料的加工目数对材料进行筛选。